黄芩：
①韧皮纤维微黄色，梭形，两端尖或钝圆
②石细胞淡黄色，类圆形、类方形、或不规则形，壁较厚
③导管主为网纹导管，分子较短，端壁倾斜，常延长成尾状
④纺锤形木薄壁细胞伴导管旁，壁厚，非木化，中部有横隔
⑤木纤维微木化，有斜纹孔及具缘纹孔
⑥韧皮薄壁细胞纺锤形或长圆形，壁常呈连珠状增厚
黄连：
①韧皮纤维鲜黄色，纺锤形或长梭形，壁厚，可见纹孔
②石细胞鲜黄色，边缘大多不平整或有凹凸
③导管主为孔纹导管，细小
④木薄壁细胞类长方形、梭形或不规则形，较大，木化
⑤木纤维众多，鲜黄色，纹孔稀疏
⑥鳞叶表皮细胞绿黄色或黄棕色，略呈长方形，壁微波状弯曲 此外，可见细小草酸钙方晶