1．无菌动物是研究营养的好模型。很多营养成份是靠细菌降解的。正常动物的肠道可合成维生素B和维生素K。应用无菌动物可研究那些菌可合成维生素B或K。
2．代谢研究：如胆固醇代谢和微生物关系的研究。用已知菌动物研究指出：肠道微生物能使胆汁酸起化学变化，从而减少其再吸收，而增加其排池。有些特殊的微生物种类和这种胆汁酸的代谢有关。这就为控制血清胆固醇含量和心血管疾病的研究，指出了新的课题。