耗氧有机物是指糖类、脂肪和蛋白质等较易发生生物降解的有机物，该类物质的微生物降解广泛发生于土壤和水体环境中。
糖类微生物降解的基本途径为：多糖在胞外水解酶的作用下水解生成二糖和单糖，而后进入细胞内，二糖在细胞内经胞内水解酶催化水解为单糖；在细胞内，单糖经过一系列酶促反应生成丙酮酸；丙酮酸在有氧条件下经过酶促反应降解为CO₂和H₂O，而在无氧条件下转化生成简单有机酸、醇和CO₂等。
脂肪的微生物降解：脂肪是由脂肪酸和甘油结合而成的酯。常温下，动物脂肪呈现固态，而植物脂肪呈现液态。脂肪微生物降解的基本途径为：在胞外水解酶作用下，脂肪水解为脂肪酸和甘油而进入细胞内；甘油经一系列酶促反应降解为CO₂和H₂O，而在无氧条件下转化生成简单有机酸、醇和CO₂等。
蛋白石微生物降解：蛋白质是一类由α-氨基酸通过肽键结合而成的大分子化合物。蛋白质微生物降解的基本途径为：在胞外水解酶作用下，水解生成二肽或氨基酸而进入细胞内，二肽在胞内继续水解生成氨基酸；氨基酸在胞内的转化以脱羧生成脂肪酸为主，脂肪酸可以进一步发生如前所述的转化过程。