1、优点：
（1）遗传变异易控制：使其向确定的育种目标方向发展，可提高育种工作的预见性和准确性。
（2）目标性状易操作：回交育种的选择，主要是针对被转移的目标性状，因此只要这种性状得到表现，在任何环境条件下均可进行，有利于缩短育种年限，加速育种进程。
（3）重组频率易增加：由于回交育种采取杂交和个体选择的多次循环过程，有利于打破目标基因和不利基因间的连锁，增加基因重组频率，从而提高优良重组类型出现的几率。
（4）所育品种易推广：回交育成的品种其形态特征、适应范围以及所需的饲养条件等与原品种相似，所以不一定要进行严格的产量试验和鉴定就可以推广，且易于为养殖者所接受。
2、缺点：
（1）回交育种只改进原品种的个别缺点，不能选育具有多种新性状的品种。
（2）回交改良品种的目标性状多局限于少数主要基因控制的性状，其遗传力高，又便于鉴别，
（3）从非轮回亲本转移某一目标性状的同时，由于与不利基因连锁或一因多效的缘故，可能将某些不利的非目标性状基因也一并带给轮回亲本。为此，必须进行多次回交，才能打破连锁。
（4）回交的每一世代都需要进行较大数量的杂交和选择，工作量较大。