（1）司法赔偿采用特殊的归责原则，它和行政赔偿的违法归责原则不同，司法赔偿以违法原则为主，以结果责任原则为辅，而且司法赔偿中的违法归责原则有其特定的含义。
（2）司法赔偿的范围比行政赔偿要窄，实行有限赔偿原则。
a.在刑事赔偿中，只对无罪被羁押者给予赔偿，而对轻罪重判、有罪的人超期羁押都不予赔偿；
b.在民事诉讼、行政诉讼中，只对违法采取妨碍诉讼行为的强制措施、财产保全措施、执行措施等造成的损害予以赔偿，而对错判造成的损害不予赔偿。
（3）司法赔偿适用独特的程序，既不适用民事赔偿的程序，也不适用行政赔偿的程序，而是采用非讼的途径来解决司法赔偿争议。