双水相萃取技术（Aqueous two-phase extraction，ATPE） 是指把两种聚合物或一种聚合物与一种盐的水溶液混合在一起，由于聚合物与聚合物之间或聚合物与盐之间的不相溶性形成两相的新型分离技术。
双水相体系的形成主要是由于高聚物之间的不相溶性，即高聚物分子的空间阻碍作用，互相无法渗透，不能形成均一相，从而分相。
两相间的界面张力小，易分散，有利于强化相际间的物质传递；
操作条件温和，可以在常温常压下进行，有助于保持生物活性；
传质和平衡速度快，回收率高，分相时间短，能耗较低，而且可以实现快速分离；
大量杂质能够与所有固体物质一起去掉，使整个分离过程更经济；
含水量高，不会引起生物活性物质失活或变性；
一般不存在有机溶剂的残留问题，对人体无害，对环境污染小；
易于连续化操作， 设备简单，并且可直接与后续提纯工序相连接；
分配过程影响因素较多，可以采取多种手段来提高分配选择性或过程收率。
易乳化，部分相分离时间长，成本高，黏度大，回收困难。

有效成分浓度低，杂质含量高，需多步分离；
有效成分不稳定，分离需谨慎；
批次间存在差异；
事关人命。

①通过提高搅拌转速或通气流速；
②降低发酵液黏度；
③控制菌浓；
④控制补料速度。