（1）从染菌时间分析： 早期：培养基灭菌不彻底、种子带菌等； 中后期：设备渗漏、空气系统。
（2）从染菌类型分析： 耐热的芽孢杆菌：灭菌不彻底，净化空气带菌，设备渗漏； 无芽孢的球菌、酵母等：设备渗漏。
（3）从染菌幅度分析： 个别罐：料液或设备灭菌不彻底； 大面积罐：空气系统、种子、公用设备存在染菌。