特点：（1）天冬氨酸激酶（AK），在黄色短杆菌中是一个变构酶，并有两个活性中心，分别受Lys、Thr的协同反馈抑制。
（2）黄色短杆菌中，存在两个分支点的优先合成机制，即优先合成Hos，然后再优先合成Met，当Met过量时，阻遏：催化Hos琥珀酰高丝氨酸所需要的酶的合成（即琥珀酰高丝氨酸合成酶），使代谢流向合成Thr的方向进行，当Thr过量时，反馈抑制：Asp-β-半醛Hos所需要的酶的的活性（即高丝氨酸脱氢酶），使代谢流向Lys的合成。
控制要点：根据以上代谢特点，利用黄色短杆菌生产Lys，需要选用Hos-，尽管，从理论上讲，选育Hos-进行赖氨酸发酵，如果在其培养基中限量供给Thr，则AK酶的活性不会受到Lys的反馈抑制，实际上Lys对AK酶的活性存在一定的抑制作用。因此，对于黄色短杆菌的Lys发酵，仅仅选育Hos-是不够的，但是为了高效率的转化Lys，可以选育结构类似物抗性突变株：
①S-L-半胱氨酸抗性突变株AECr
②γ-甲基赖氨酸抗性突变株MLr
③L-赖氨酸氧肟酸盐抗性突变株LysHxr
④苏氨酸氧肟酸盐抗性突ThrHxr使用黄色短杆菌进行赖氨酸的发酵，还可以选育具有双重标记的营养缺陷型突变株（Met- + Thr-），其本质上和Hos-是一样的，但双重标记的营养缺陷型突变株的优点是：遗传性质稳定，恢复突变的几率少。