1.利用基因工程改造食品微生物。如面包酵母菌，啤酒酵母。
2.利用基因工程改善食品原料的品质。如提高植物性食品氨基酸产量
3.利用基因工程改进食品生产工艺。如改善牛乳加工特性。
4.利用基因工程生产食品添加剂及功能性食品。如生产木糖醇，生产氨基酸
5.利用基因工程进行食品包装和食品检测。如利用PCR技术检测是否为转基因食品。
6.利用生物技术处理食品工业废水。