一级结构：肽键、二硫键（都属于共价键）
二级结构：氢键（主链上—C=O—和N—H之间形成）
三、四级结构：二硫键、次级键（氢键疏水键、疏水键、离子键、华力、配位键）

除脯氨酸外，脯氨酸（Pro）的侧链R-基与主链N原子共价结合，形成一个环状的亚氨基酸，其他均具有如下结构通式。