⑴成岩作用：成岩过程中的机械压实作用、胶结作用及自生矿物的析出，使储层物性变差，而溶解作用、白云化作用及裂缝的发育可改善物性。
⑵沉积环境：由于沉积条件不同，如水流的强度和方向、沉积区的古地形、古水深、距离物源区的远近、碎屑物质的供应等，以及沉积碎屑物的成分、粒度、分选程度、胶结类型、孔隙充填、砂体形态、侧向连续性、纵向连通性、厚度等都不同，造成储层的岩性、物性和内部结构、层理构造在纵向上和横向上都有不同程度的差异。陆相储集层的非均质性比海相储集层要强：侧积对应强烈的正韵律非均质性；垂积对应无规则或叠加正韵律非均质性；前积对应明显的反韵律非均质性；填积对应较弱的正韵律非均质性；选积对应反韵律或复合韵律非均质性；漫积对应近均质层。
⑶构造作用：构造活动影响盆地沉积物的埋藏史、成岩作用发育史、孔隙发育史：
①构造活动影响碎屑岩母岩性质
②构造活动影响区域地热梯度的变化
③构造运动所产生的断层和裂缝也对储层非均质性有一定影响
④构造活动与初级岩裂缝系统及微裂缝的发育程度有关