果蝇体型较小、世代周期较短，便于大量养殖，获得较大的遗传研究群体；也便于进行杂交试验与细胞学研究；果蝇为XY型性别决定的雌雄异体动物；具有丰富的遗传类型。摩尔根等人通过在培养的红眼雄果蝇群体中发现白眼个体，研究证实了基因突变的存在；发现果蝇眼色基因与性染色体/性别之间的对应关系，证明了基因位于染色体上；同时也发现了基因的性连锁遗传现象；在果蝇连锁遗传研究的基础上，揭示了连锁遗传规律

呈现不连续变异的性状叫做质量性状；表现连续变异的性状叫做数量性状。其异同见下表