根据病史、病因、临床表现及X线摄片检查等，对边缘性颌骨骨髓炎一般均不难得出较正确的诊断。急性颌骨骨髓炎的主要诊断依据是全身及局部症状明显，与间隙感染急性期表现相似。
病源牙以及相邻的多数牙出现叩痛，松动，甚至牙槽溢脓。患侧下唇麻木是诊断下颌骨骨髓炎的有力证据。
上颌骨骨髓炎波及上颌窦时，可有上颌窦炎症状，有时从患侧的鼻腔溢脓。慢性颌骨骨髓炎的主要诊断依据是屡道形成和溢脓；死骨形成后，可从瘘孔排出小死骨片；瘘道用探针检查可触及骨面粗糙。全身症状不明显，进食睡眠正常。
X.线摄片检查在骨髓炎的急性期常看不到有骨质的破坏。一般在发病2－4周，进入慢性期，颌骨已有明显破坏后，X线摄片检查才具有诊断价值。儿童颌骨骨髓炎一般7－10天后才能开始形成死骨。
颌骨骨髓炎的X线检查可表现为骨质破坏和骨质增生，前者典型变化是骨小梁排列乱与死骨形成；后者主要表现为骨膜反应性增生。详细的X线影像描述可参见《口腔颌面X线诊断学》颌骨骨髓炎部分。
急性边缘性颌骨骨髓炎的早期难以确诊，多数是在脓肿形成后进行切开引流时，才发现骨面粗糙，经X线摄片检查后方予确诊。