孢子培养基：是供菌种繁殖孢子用的。对这种培养基的要求是能使菌种发芽生长快，产孢子量多，并且不会引起菌种变异。一般来说，孢子培养基中的碳源和氮源（特别是有机氮源）浓度相对较低，多了会只长菌丝，少长或不长孢子；无机盐浓度要作适当的选择和控制，否则会影响孢子的数量。
种子培养基：主要指摇瓶种子及种子罐用的培养基。这种培养基主要含有容易被利用或粗壮和使各种有关的初级代谢酶的活力提高。种子培养基要和发酵培养基相适应，成分不应相差太大，以避免进罐后的种子对新环境的适应时间延长。
发酵培养基：是供菌丝迅速生长繁殖，并最大限度地获得代谢产物的培养基。它既要使种子接种后能迅速生长达到一定的菌丝浓度，又要使长好的菌体能迅速合成所需的产物，因此，发酵培养基的组成除有菌体生长所必需的元素和化合物外，还要有产物所需的特定元素、前体和促进剂等。

主要从以下三个方面来分析：
⑴大批发酵罐染菌
⑵部分发酵罐染菌
⑶个别发酵罐染菌