定义：应用生物化学和遗传学原理，深入研究微生物合成代谢途径及代谢调控机制，设计出选择性筛选子，通过遗传育种技术获得解除或绕过了微生物正常代谢途径的突变株，即定向选育某种特定的突变型，以达到大量积累目标产物的目的。
特点：定向性、降低工作量、提高了筛选效率。
应用：初级代谢产物（氨基酸、核苷酸）的育种中得到了广泛的应用。