1.遗传原因：如牛奶的乳糖不耐症；牛奶对绝大多数人来说是营养丰富的食品，但有些人由于先天缺乏乳糖酶，不能将牛奶中的乳糖分解为葡萄糖和半乳糖，因而不能吸收利用，而且饮用牛奶后还会发生腹胀、腹泻等症状。
2.过敏反应：食物成分和食用量都正常，因个人的过敏反应而发生症状。引起过敏的食物称过敏原食物。各种肉类、鱼类、蛋类以及各种蔬菜、水果都可能成为某些人的过敏原食物。如菠萝是很多人喜欢的水果，但有人对菠萝中含有的一种蛋白酶过敏，当食用菠萝或菠萝汁后出现腹浦、恶心、呕吐、腹泻等症状，同时有头痛、四肢及口舌发麻、呼吸困难，严重者可引起休克、昏迷。
3.食用量过大：如连续多日大量吃鲜荔枝，可引起“荔枝病”；发病时有饥饿感、头晕、心悸、无力、出冷汗，重者有抽搐、瞳孔缩小、呼吸不规则、甚至死亡。发病原因可能与荔枝中含有的一种叫α－次甲基环丙基甘氨酸的物质有关，该物质有降低血糖的作用。
4.食物成份不正常：如河豚鱼、鲜黄花菜、毒蘑菇等，少量食用亦可引起中毒。