行政事业性收费的申请、审批和实施都有可能出现违法的现象，而违法的主体可能是收费单位、审批收费的各级政府部门以及各级价格、财政部门中从事收费管理工作的工作人员。
依照《行政事业性收费标准管理暂行办法》的相关规定，收费单位有下列情形之一的，由各级价格、财政部门按照职责分工令其改正，并按有关规定予以处罚：
（1）自行提高收费标准、延长收费时限、增加收费频次等违规乱的；
（2）继续收取已明令取消或停止执行的收费标准的；
（3）未按规定向社会公示收费项目、收费标准收费的；
（4）未按规定申领收费许可证或办理变更手续等收费的；
（5）其他违反收费管理规定的。
各级政府及其部门《办法》规定，擅自审批收费标准的，应当责令其改正，情节严重的要给予通报批评，并对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分。各级价格、财政部门工作人员在收费管理工作中，滥用职权、徇私舞弊、玩忽职守、索贿受贿，构成犯罪的，依法追究刑事责任；尚不构成犯罪的，依法给予处分。