疾病的发生，是在某种致病因素的影响下，机体“阴平阳秘”的正常生理平衡被破坏，从而导致“阴阳失调”而发病。疾病是一个复杂的病理过程，但形成“阴阳失调”的原因不外两方面：一是机体本身的功能紊乱或失调；二是致病因素对机体的影响或损害。因此，疾病是指机体在致病因素作用下，气血紊乱，阴阳失调，脏腑经络组织功能发生异常，对外界环境适应能力降低，出现一系列的临床症状或体征的异常生命过程。
在疾病的发生、发展过程中，正气与邪气矛盾双方的力量对比，决定着疾病发展的方向和结局。因此，疾病的过程就是邪正斗争的过程，邪正斗争是疾病发生发展的基本原理。一方面，邪气侵犯，损伤人体；另一方面，机体正气抗邪驱邪外出，邪正相搏，若正能胜邪，则不发病；若邪胜正负，则发病。因此，正气的强弱，决定着发病与否，并与发病的部位、感邪的轻重、发病的证候性质等密切相关，正气在发病中起着主导作用，正气不足是发病的内在根据。而病邪的性质、强弱、所中部位等与发病密切相关，邪气侵犯是导致人体发病的外部条件。此外，环境因素，如季节气候、地域、生活工作环境、社会环境等，以及机体素质，亦与发病关系较为密切。