基本结构：细胞壁、细胞膜、细胞质、核质
细胞壁的功能：
⑴维持菌体的固有形态，保护细菌抵抗外界低渗环境；
⑵参与菌体内外物质交换；
⑶带有多种抗原，决定细菌的免疫原性。诱发机体产生免疫应答并与血清分型有关。
⑷G-菌外膜是一种屏障结构，阻止某些抗生素的进入，成为细菌耐药的机制之一。
⑸某些G⁺有表面蛋白、G^-菌内毒素等与细菌的致病性有关。
⑹与细菌染色性密切相关。
细胞膜的功能：
⑴物质转运；
⑵生物合成；
⑶细胞呼吸；
⑷形成中介体，参与细菌分裂等。细
胞质的功能：是细菌合成蛋白质和核糖核酸的场所；是细菌进行新陈代谢的场所。
质的功能：是细菌的遗传物质，控制细菌的各种遗传性状。
细菌的特殊结构：荚膜、鞭毛、菌毛、芽孢。
荚膜的功能：
⑴抗吞噬作用；
⑵黏附作用；
⑶抗有害物质的损伤；
⑷具有抗原性。
鞭毛的功能：
⑴是细菌的运动器官；
⑵有些鞭毛（如霍乱弧菌、空肠弯曲菌）与细菌的致病性密切相关；
⑶具有抗原性，可籍此鉴定细菌及对细菌分类
菌毛的功能：
⑴普通菌毛：细菌的黏附结构，与细菌的致病性有关。
⑵性菌毛：介导接合，细菌的毒力、耐药性等性状可通过此方式传递
⑶为某些噬菌体的受体。
芽孢的功能：
⑴根据芽孢形态、大小以及在菌体中的位置，有利于细菌的鉴别；
⑵杀死芽孢为灭菌的可靠指标；
⑶可以成为某些传染病潜在的传染源：芽孢本身不致病，但当它发芽转变为繁殖体后，可引起疾病。在人类，有四种常见的严重的传染病是由能形成芽孢的细菌引起的——炭疽杆菌、肉毒梭菌、破伤风梭菌和产气荚膜梭菌。