（1）抗ds-DNA抗体主要见于SLE，是目前公认的SLE高度特异性抗体，被列为SLE分类标准之一。在未治疗的SLE患者中，抗ds-DNA抗体的诊断特异性为90％，敏感性为70％。有时其它CTDs（pSS、MCTD等）患者抗ds-DNA抗体也可阳性，但阳性率低于10％，且抗体效价也较低。
（2）抗ds-DNA抗体与SLE疾病活动性关系密切。血清抗ds-DNA抗体水平升高，提示疾病复发；血清抗ds-DNA抗体呈高水平（特别伴血清低补体时）提示发生狼疮肾炎的危险性大。SLE缓解期其血清抗ds-DNA抗体水平降低甚至转阴。因此，抗ds-DNA抗体常作为SLE活动的指标，可用于监测病情变化、判断疾病活动性、观察药物治疗效果等。
（3）抗ds-DNA抗体在SLE发病机制中起重要作用。循环中或器官原位DNA可与循环抗ds-DNA抗体发生反应，形成抗原抗体免疫复合物，激活补体等炎症系统，在一些器官（如肾脏、肺、关节和脑组织）引起组织损伤，表现为肾小球肾炎、关节炎、皮肤红斑、神经精神症状及多部位血管炎等。
目前认为，抗DNA抗体是具SLE特征性的自身抗体，特别是高亲合性的IgG型抗ds-DNA抗体在诱发SLE全身性损害（尤其是肾损害）中起重要作用，对SLE的诊断具有较高的特异性，且可作为狼疮活动的标志。