答：在发现自己怀孕时已经有两个月的孕期，可能是因为没有及时发现怀孕的症状，也可能是因为月经周期不规律导致的。

1. 没有及时发现怀孕的症状：有些女性在怀孕早期可能没有明显的症状，或者是没有注意到怀孕的症状。例如，恶心、呕吐等早孕反应可能在怀孕后几周才出现，而乳房胀痛、疲劳等症状也可能不明显。如果没有及时进行孕检，就可能在发现时已经有两个月的孕期。

2. 月经周期不规律：如果女性的月经周期不规律，可能会导致计算孕周的时间出现误差。如果月经周期较长，那么在发现怀孕时可能已经有两个月的孕期。

总之，在发现自己怀孕时已经有两个月的孕期可能是多种原因导致的。如果有疑虑，建议及时咨询医生，医生会根据具体情况进行详细的检查和解释。

*重要提示：科普内容不能作为疾病治疗依据，如有不适请前往正规医院就诊。