答：新生儿巨细胞病毒感染一般采用更昔洛韦等抗病毒药物进行治疗，但可能出现一些副作用，如骨髓抑制、肝功能损害、消化道反应、皮疹等。

1. 骨髓抑制：更昔洛韦主要的副作用是对骨髓的抑制作用，可引起粒细胞减少、血小板减少等，因此在治疗过程中需要定期复查血常规。

2. 肝功能损害：更昔洛韦还可能引起肝功能损害，导致转氨酶升高、胆红素升高等，因此在治疗过程中需要定期复查肝功能。

3. 消化道反应：抗病毒药物可能会引起一些消化道反应，如恶心、呕吐、腹泻等，一般停药后可缓解。

4. 皮疹：少数患者可能会出现皮疹、皮肤瘙痒等过敏反应。

需要注意的是，新生儿巨细胞病毒感染的治疗需要严格遵循医生的建议和指导，并密切观察病情变化，出现异常情况及时就医，以便及时调整治疗方案，降低药物副作用的风险。

*重要提示：科普内容不能作为疾病治疗依据，如有不适请前往正规医院就诊。