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生物信息学章节练习(2020.06.08)
- 填空题
常用的三种序列格式：（）
答案：NBRF/PIR，FASTA和GDE - 问答题
试述SWISS-PROT中的数据来源。
答案：（1）从核酸数据库经过翻译推导而来；
（2）从蛋白质数据库PIR挑选出合适的数据；
（3）从科学... - 名词解释
分子钟
答案：认为在进化过程中物种间分子进化速率是恒定的或者几乎不变的假说，即蛋白序列间的氨基酸替换数正比于序列间的分歧世代数。意义：... - 名词解释
序列表谱（profile）
答案：是一种特殊位点或模体序列，在多序列比较的基础上，氨基酸的权值和空位罚分的表格。
- 问答题
BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途什么？
答案：blastn是将给定的核酸序列与核酸数据库中的序列进行比较；Blastp是使用蛋白质序列与蛋白质数据库中的序列进行比较，... - 问答题
简述DNA计算实现方式中，表面方式与试管方式相比具有哪些优点？
答案：试管方式：就是在一个或多个试管的溶液里进行生化反应；
表面方式：是将对应的解空间的DNA分子固定在一块固体上，... - 名词解释
GenPept
答案：是由GenBank中的DNA序列翻译得到的蛋白质序列。数据量很大，且随核酸序列数据库的更新而更新，但它们均是由核酸序列翻... - 名词解释
无根树（unrooted tree）
答案：只表明节点间的关系，无进化发生方向的信息，通过引用外群或外部参照物种，可以在无根树中指派跟节点。（一种系统发育树，所有在...