A中烟工业公司位于甲省乙市，2016年9月1日，根据卷烟购销合同在专卖证件管理系统申办了一份有效期为10天的卷烟准运证，目的地为丙省丁市烟草公司仓库。经甲省乙市烟草专卖局审批后，A中烟工业公司于当日打印了准运证。第二天，A中烟工业公司发现准运证打印错误。在重新打印好准运证后，A中烟工业公司安排小赵携带准运证和卷烟购销合同复印件进行运输。2016年9月10日，卷烟运输至目的地，丁市烟草公司在验货无误后一直没有对准运证进行任何处理。请根据材料回答下列问题：
1.A中烟工业公司在发现准运证打印错误后，应向哪个机关申请作废准运证?对该作废后的准运证应如何管理?
2.请指出材料中准运证使用的错误之处并给出正确做法。