菊花育种的目标主要有：花期（多种花期）；花色（蓝色、黑色、复色、大花艳丽等）；花型（大花、小花、重瓣等）；株形（满足不同的用途）；抗性（抗病虫、抗逆境等）。
实现育种目标的技术途径为：引种；实生选种；人工杂交育种；芽变选种；诱变育种（辐射诱变、化学诱变、航空诱变）；生物技术育种。