《铁路货物运价规则》对货运收入的计算程序作了明确的规定，具体内容如下：
（1）按《货物运价里程表》计算出发站至到站的运价里程。
（2）根据货物运单上填写的货物名称查找《铁路货物运输品名分类与代码表》、《铁路货物运输品名检查表》，确定适用的运价号。
（3）整车、零担货物按货物适用的运价号，集装箱货物根据箱型、冷藏车货物根据车种分别在“铁路货物运价率表”中查出适用的运价率（即基价1和基价2，以下同）。
（4）根据《铁路货物运价规则》确定计费重量。
（5）货物适用的基价1加基价2与货物的运价里程相乘之积，再与按确定的计费重量（集装箱为箱数）相乘，计算出运费。
（6）计算杂费。