用于酶进行催化反应的容器及其附属设备称为酶反应器。
按结构区分：
⑴拌罐式反应器：反应比较完全，反应条件容易调节控制。
⑵鼓泡式反应器：鼓泡式反应器的结构简单，操作容易，剪切力小，混合效果好，传质、传热效率高，适合于有气体参与的反应。
⑶填充床式反应器：密度大，可以提高酶催化反应的速度。在工业生产中普遍使用。
⑷流化床式反应器：流化床反应器具有混合均匀，传质和传热效果好，温度和pH值的调节控比较容易，不易堵塞，对粘度较大反应液也可进行催化反应。
⑸膜反应器：清洗比较困难。