特异投射系统是指通过丘脑的感觉接替核按规则秩序排列投射到大脑皮层的特定区域，并引起特定感觉的投射系统。通过丘脑联络核投射到大脑皮层的部分，虽不引起特定的感觉，但其在大脑皮层有特定的投射区域，所以也属于特异投射系统。特异投射系统的纤维大部分 终止于大脑皮层的第4层，终止的区域狭窄，其功能是将机体所受到的环境变化的信息快速、准确地传送到相应的大脑皮层感觉区，引起各种特定的感觉，并激发大脑皮层发出传出冲动，以实现其最高级中枢的调节功能。
非特异投射系统是指各种感觉冲动上传至大脑皮层的共同上行通路。特异性感觉纤维经过脑干时，都发出侧支与脑干网状结构的神经元发生突触联系，通过其短突触多次更换神经元后 ，抵达丘脑的皮质下联系核（非特异性核群），再发出纤维弥散地投射到大脑皮层的广泛区域 。由于上行过程中经过脑干网状结构神经元的错综复杂的换元传递，因而失去了特异感觉的 特异性和严格的定位区分，上行纤维广泛终止于大脑皮层的各层细胞，不引起特定的感觉，所以称非特异投射系统。其主要功能是维持和改变大脑皮层的兴奋状态。

①对摄食活动的调节；
②对水平衡的调节；
③对情绪反应的影响；
④对体温调节；
⑤对内分泌的调节。