牙本质龋由深层到表层可分为透明层、脱矿层、细菌侵入层、坏死崩解层。（1）透明层位于病变的最前沿，矿物盐晶体沉积于牙本质小管内。（2）脱矿层是在透明层的表面，细菌侵入之前，酸的扩散所导致的脱矿现象。（3）细菌侵入层位于脱矿层表面，牙本质小管内有细菌侵入。（4）坏死崩阶层为牙本质龋的最表层，随着液化坏死灶扩大，数量增多牙本质完全崩解破坏，只残留一些坏死崩解组织。