（1）种子：有性繁殖植物最常用的处理材料。优点：操作方便、能大量处理、便于运输和贮藏，对环境适应能力强，可以在极度干燥、高温、低温或真空以及存在氮气或氧气等条件下进行处理，适于进行诱变效应等研究。缺点：需要剂量大、强度大的放射源。
（2）绿色植株：整体照射即在r圃、r温室或有屏蔽的人工气候室内进行室内处理。局部照射即照射花序、花芽或生长点，可以在整个生育过程连续照射，也可只处理某个发育时期。
（3）花粉：优点：不会形成嵌合体，经照射一旦突变，雌雄配子结合为异质合子，由合子分裂产生的细胞都带有突变。
（4）子房：照射子房可以引起卵细胞突变，还可以诱发孤雌生殖，对雄性不育植株更简便。
（5）合子和胚细胞：合子和胚细胞处于旺盛的生命活动中，辐射诱变效果较好，特别是照射第一次有丝分裂前的合子，可以避免形成嵌合体，提高突变频率。
（6）营养器官
（7）离体培养中的细胞和组织：单细胞培养物、愈伤组织等。

选择综合性状好、适应性良好的推广品种，高世代稳定的优良品系，单倍体、多倍体或原生质体，杂种一代。

①突变率高，染色体畸变少
②对处理材料损害轻，特定部位变异
③生物损伤大，生活力育性下降